Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRGAP3O43295 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms