Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPSS1O43252 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAPSS1O43252 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PAPSS1O43252 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms