Protein–RNA interactions for Protein: O43194

GPR39, G-protein coupled receptor 39, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR39O43194 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR39O43194 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR39O43194 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR39O43194 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR39O43194 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR39O43194 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR39O43194 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPR39O43194 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPR39O43194 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR39O43194 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR39O43194 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR39O43194 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR39O43194 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR39O43194 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR39O43194 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR39O43194 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR39O43194 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR39O43194 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR39O43194 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR39O43194 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms