Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2DO15514 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2DO15514 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms