Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPATO15228 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GNPATO15228 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPATO15228 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNPATO15228 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GNPATO15228 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNPATO15228 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNPATO15228 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPATO15228 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GNPATO15228 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GNPATO15228 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GNPATO15228 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GNPATO15228 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPATO15228 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPATO15228 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GNPATO15228 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GNPATO15228 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPATO15228 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPATO15228 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPATO15228 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms