Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASKO14936 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASKO14936 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASKO14936 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASKO14936 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASKO14936 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASKO14936 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASKO14936 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASKO14936 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASKO14936 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASKO14936 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASKO14936 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASKO14936 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASKO14936 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms