Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
O00370 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
O00370 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
O00370 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
O00370 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
O00370 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
O00370 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
O00370 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
O00370 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
O00370 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
O00370 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
O00370 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
O00370 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
O00370 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
O00370 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
O00370 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
O00370 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms