Protein–RNA interactions for Protein: O00339

MATN2, Matrilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN2O00339 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN2O00339 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN2O00339 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN2O00339 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN2O00339 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN2O00339 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN2O00339 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN2O00339 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN2O00339 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN2O00339 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN2O00339 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN2O00339 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN2O00339 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN2O00339 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN2O00339 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN2O00339 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN2O00339 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN2O00339 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN2O00339 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN2O00339 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN2O00339 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms