Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3CDO00329 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIK3CDO00329 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIK3CDO00329 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms