Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFXAPO00287 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFXAPO00287 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFXAPO00287 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms