Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF103O00237 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF103O00237 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF103O00237 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF103O00237 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF103O00237 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF103O00237 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF103O00237 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF103O00237 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF103O00237 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF103O00237 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF103O00237 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF103O00237 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF103O00237 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF103O00237 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms