Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TK2O00142 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK2O00142 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK2O00142 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK2O00142 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK2O00142 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK2O00142 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TK2O00142 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TK2O00142 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TK2O00142 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TK2O00142 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TK2O00142 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TK2O00142 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TK2O00142 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TK2O00142 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TK2O00142 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK2O00142 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TK2O00142 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK2O00142 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK2O00142 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK2O00142 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK2O00142 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TK2O00142 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TK2O00142 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms