Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNH8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H3BNH8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H3BNH8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H3BNH8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H3BNH8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H3BNH8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H3BNH8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H3BNH8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H3BNH8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BNH8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BNH8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BNH8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H3BNH8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms