Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NACAE9PAV3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NACAE9PAV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms