Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRRN3E7EW58 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms