Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPB11E5RHQ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11E5RHQ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPIPB11E5RHQ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NPIPB11E5RHQ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms