Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP17L12C9JPN9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP17L12C9JPN9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L12C9JPN9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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