Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC169A6NNP5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC169A6NNP5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms