Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBX1A6NMT0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DBX1A6NMT0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms