Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA8JA6NMD2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA8JA6NMD2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms