Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD2

TSPY2, Testis-specific Y-encoded protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPY2A6NKD2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPY2A6NKD2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPY2A6NKD2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPY2A6NKD2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms