Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM49BA6NDI0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM49BA6NDI0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms