Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCHNA4D1U4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCHNA4D1U4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms