Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC66A2RUB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC66A2RUB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC66A2RUB6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms