Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms