Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A0U1RQF3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms