Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087X1B8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A087X1B8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms