Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAF6Q9Y4K3 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAF6Q9Y4K3 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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TRAF6Q9Y4K3 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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