Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms