Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms