Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SIRT1Q96EB6 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms