Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms