Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms