Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTC1Q2NKJ3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTC1Q2NKJ3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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