Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms