Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
POLR2KP53803 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
POLR2KP53803 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms