Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms