Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCAMP43121 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCAMP43121 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms