Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms