Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC110285.1-201ENST00000572077 665 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC007032.1-201ENST00000609281 847 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC007378.1-201ENST00000609765 478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PGAM1P2-201ENST00000436071 725 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC073592.1-201ENST00000543970 1282 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 TIPRL-201ENST00000367830 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PYY3-201ENST00000419078 213 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CLDN16-202ENST00000456423 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RN7SL309P-201ENST00000491364 286 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms