Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRMT13Q9NUP7 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRMT13Q9NUP7 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRMT13Q9NUP7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TRMT13Q9NUP7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TRMT13Q9NUP7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRMT13Q9NUP7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRMT13Q9NUP7 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRMT13Q9NUP7 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRMT13Q9NUP7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRMT13Q9NUP7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TRMT13Q9NUP7 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRMT13Q9NUP7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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