Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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FANCFQ9NPI8 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FANCFQ9NPI8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FANCFQ9NPI8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FANCFQ9NPI8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FANCFQ9NPI8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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