Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms