Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TCF23Q7RTU1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms