Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMPOP42166 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms