Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLD1P28340 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLD1P28340 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLD1P28340 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms