Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FANCFQ9NPI8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms