Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 PABPC1P11-201ENST00000428966 2007 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP005230.1-205ENST00000639316 2015 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 REG4-201ENST00000256585 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078925.4-201ENST00000623737 1717 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 KNOP1P4-201ENST00000445020 1438 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL2A-201ENST00000311506 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBCCD1-205ENST00000446782 2186 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 NANOGP1-202ENST00000607111 1982 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIN4-204ENST00000423432 1605 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR10P1-201ENST00000309675 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETNK2-201ENST00000367197 843 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARF1P1-201ENST00000406466 544 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms