Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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