Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP2C1P98194 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms